Тогда храм получил название Хваом Пульгукса, а позднее был переименован и стал называться Помнюса. В 751 году во время правления короля Кёндок-вана (742-765 гг.) под руководством премьер-министра Ким Дэ Сона (700-774 гг.) начались работы по реконструкции храма, которые завершились в 774 году уже при следующем правителе – государе Хегон-ване (765-780 гг.). Через 17 лет после окончания строительных работ храм снова переименовали, дав ему название Пульгукса, которое сохраняется за ним и по сей день. Храм многократно перестраивался при правителях династий Корё (918-1392 гг.) и Чосон (1392-1910 гг.), но название его больше не меняли. В XVI веке во время Имчжинской войны с Японией (1592-1598 гг.) храм очень сильно пострадал: все деревянные строения были сожжены. Их восстановили через несколько лет.
Работы по восстановлению лежащего в руинах храма начались в 1604 году при государе Сончжо династии Чосон. В течение последующих двух столетий храм реставрировали и реконструировали ещё около 40 раз, так как он неоднократно страдал от грабителей и вандалов. В 1969 году был сформирован комитет по восстановлению храма Пульгукса. К 1973 году павильоны Мусольчжон, Кванымчжон, Пирочжон, Кённу и Хверан, которые на тот момент были разрушены практически до основания, отстроили заново. Другие старые и подвергшиеся разрушению строения, такие как павильоны Тэунчжон, Кыннакчжон, Помённу и ворота Чахамун, были также отреставрированы.
